小林さくらは、高校二年生の女の子。勉強もスポーツも平凡で、特に目立つところがない。彼女は自分の将来に悩んでいた。
ある日、学校で歴史の授業を受けているとき、先生が江戸時代の古地図を持ってきた。さくらはその地図に興味を持ち、手に取ってみた。すると、突然地図が光りだし、さくらは気を失ってしまった。
気がついたとき、さくらは見知らぬ場所にいた。周りには木造の家や土塀があり、人々は着物や袴を着ていた。さくらは驚いて地図を見ると、それは江戸時代の東京（当時は江戸）の地図だった。
どうやら、さくらは地図によってタイムスリップしてしまったようだ。
さくらはパニックになり、現代に戻る方法を探そうとした。しかし、何もわからなかった。そこへ、若い侍が現れた。彼は佐々木信之と名乗り、さくらが迷子だと思って声をかけてきた。
信之はさくらの不審な服装や言葉遣いに疑問を持ったが、優しくしてくれた。信之はさくらを自分の家に連れて行き、世話をしてくれることになった。
さくらは信之の家で暮らすことになり、江戸時代の生活に慣れようとした。しかし、さくらは現代人だったので、さくらの振る舞いは江戸時代では奇妙な行動とみなされる。さくらは信之やその家族に迷惑をかけてしまったが、同時に彼らの心を動かしていった。
一方、信之は幕府の役人である大岡忠相の部下として働いていた。大岡忠相は悪徳商人や盗賊などを裁く名奉行として知られていた。信之は大岡忠相の命令で、様々な事件に関わっていった。
その中で、さくらも信之と一緒に事件解決に協力することになった。さくらは現代の知識や技術を使って、江戸の人々を助けたいと思ったからだ。
しかし、さくらは現代に戻る方法を探さなければならなくなった。それは地図が徐々に色あせていくからだった。地図が消えたら、現代に戻れなくなるかもしれないと思ったからだ。
ある日、信之は大岡忠相から、江戸城で起きた殺人事件の捜査を命じられた。江戸城で将軍・徳川吉宗が暗殺されたのだった。犯人は城内の者でなければならないが、誰も疑わしい者がいなかった。
信之はさくらを連れて江戸城へ向かった。江戸城では老中・田沼意次や若年寄・松平定信など、幕府の重要人物たちが集まっていた。彼らは将軍の死に動揺していたが、事件の真相を探ろうと必死だった。
信之とさくらは事件現場を調べたが、手がかりは見つからなかった。そこへ、大岡忠相が現れた。大岡忠相はさくらの身なりを見て驚いたが、何も言わなかった。大岡忠相は事件の真相を探るために、城内の者たちを尋問した。その中で、さくらは現代の知識を使って、重要なヒントを見つけた。
さくらはそのヒントを信之に伝えた。信之はさくらの言葉を信じて、犯人を追った。しかし、犯人は逃げようとした。信之とさくらは犯人を追跡したが、途中で別れてしまった。さくらは一人で犯人と対峙することになった。
さくらは犯人から攻撃されるが、何とか逃げ延びた。しかし、そのとき地図が落ちてしまった。犯人は地図を拾って逃げようとしたが、そこへ信之が現れた。信之は犯人を取り押さえようとするが、犯人は上手くかわした。さくらは信之を助けようとしたが、逆に犯人に捕まってしまった。
犯人はさくらと地図を持って城内の隠し通路に入った。
犯人はさくらに地図の正体を問い詰めた。さくらはうまくごまかそうとしたが、犯人は信じなかった。
しかし、そのとき大岡忠相が現れた。大岡は犯人を制圧し、さくらを救出した。大岡はさくらに地図を渡した。さくらは地図を受け取って安心した。大岡はさくらに微笑んだ。
大岡はさくらに、犯人の正体を教えた。犯人は実は、現代世界の俳優だった。彼は江戸時代のドラマに出演していたが、役作りのためにタイムスリップしてしまったのだった。
彼は江戸時代で生きることになり、将軍・徳川吉宗の側近として活躍するようになった。彼は現代に戻る方法を探していたが、見つからなかった。
しかし、彼は大岡やさくらが現代から来たことを知った。彼は彼らの地図が現代に戻る鍵だと思っていた。彼は地図を奪うために、将軍を暗殺する計画を立てたのだった。
大岡はさくらに、自分も彼の正体を知っていたことを告げた。大岡は彼の計画を阻止するために、密かに動いていたのだった。大岡はさくらに、自分も彼と同じように現代に戻りたいと思っていたことを告白した。
大岡はさくらに、自分の秘密を知っているのは君だけだと言った。大岡はさくらに協力を求めた。大岡はさくらの地図が現代に戻る鍵だと思っていた。大岡はさくらに、自分と一緒に現代に戻ろうと誘った。
さくらは驚いたが、大岡の言葉を信じた。さくらは現代に戻りたいと思っていたが、彼女は信之のことを思い出した。
さくらはどうしたらいいのか、わからなかった。彼女は大岡に答えを求めたが、大岡は微笑んで言った。
「それは君自身が決めなければならないことだ」
さくらは自分の心に問いかけた。彼女は現代に戻りたいと思っていたが、信之のことも忘れられなかった。
彼女は信之に別れを告げることもできなかった。
さくらは決心した。
彼女は大岡に「すみません、私はここに残ります」と言った。
大岡は驚いたが、さくらに「君の選択を尊重する」と言った。
大岡はさくらに地図を渡した。彼はさくらに「もし君が後悔したら、この地図を使って現代に戻れるかもしれない」と言った。
彼はさくらに「でも、この地図はもうすぐ消えてしまうから、早く決めなさい」と言った。
さくらは地図を受け取った。彼女は地図を見て、涙を流した。彼女は地図を抱きしめて、ありがとうと言った。彼女は地図をポケットに入れて走り出した。
さくらは信之のもとに駆け寄った。信之はさくらに「無事でよかった！」と言った。
さくらは突然「あなたが好きだ」と思いを告げた。
信之はさくらの言葉に感動した。
信之もさくらに「俺も好きだ」と告白した。
二人は互いに想いを確かめ合った。二人は幸せそうに笑った。
二人は手をつないで歩き出した。二人は江戸時代で生きることを決めた。二人は未来への不安や現代への憧れを捨てた。二人は今を大切にすることにした。
二人のポケットから、地図が落ちていった。地図は徐々に色あせて、やがて消えてしまった。
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